Risque d’infection par BA.5 chez les personnes exposées à des variantes antérieures du SRAS-CoV-2

À propos de l’éditeur :

Au cours des derniers mois, Omicron (B.1.1.529) est devenu la variante dominante du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) et a montré un certain niveau d’évasion immunitaire.1 Les sous-variantes initiales de l’omicron, BA.1 et BA.2, sont de plus en plus remplacées par BA.5 dans de nombreux pays, probablement en raison d’une plus grande transmissibilité et d’une évasion partielle de l’immunité induite par BA.1 et BA.2.2.3 La protection offerte par BA.1 contre l’infection par le sous-variant BA.5 est essentielle puisque les vaccins appariés dans les essais cliniques sont basés sur BA.1.

Le Portugal a été l’un des premiers pays à être affecté par une domination BA.5. Nous avons utilisé le Registre national des maladies à coronavirus 2019 (Covid-19) (SINAVE) pour calculer le risque d’infection par BA.5 chez les personnes ayant une infection documentée avec des variantes précédentes, y compris BA.1 et BA.2. Le registre comprend tous les cas signalés dans le pays, quelle que soit leur présentation clinique.

Effet protecteur d’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 sur l’infection par la sous-variante Omicron BA.5.

Comme le montre le panneau A, nous avons identifié les périodes (dans différentes couleurs) où une variante était présente dans plus de 90 % des isolats de l’échantillon (données du National Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 [SARS-CoV-2] Surveillance de la diversité génétique4). Les périodes grises représentent les moments où plus d’une variante était en circulation. Compte tenu de la transition relativement lente entre la dominance de la sous-variante omicron BA.1 et la dominance de la sous-variante omicron BA.2, nous avons regroupé BA.1 et BA.2 dans l’analyse. Nous n’avons recruté aucune personne infectée par la sous-variante omicron BA.5 dans les 90 jours précédant la dominance. Le panneau B montre l’efficacité protectrice contre l’infection pendant la période de dominance BA.5 (à partir du 1er juin 2022) chez les individus infectés au cours des périodes de dominance de différentes variantes, comme présenté dans le panneau A, par rapport aux individus sans infection documentée jusqu’au 1er juin. . Les personnes atteintes de deux infections avant le 1er juin n’ont pas été incluses dans l’étude. 𝙸 Les barres représentent les intervalles de confiance à 95 %.

La surveillance génétique nationale du SRAS-CoV-2 a identifié des périodes où des variantes distinctes représentaient plus de 90 % des isolats.4 Nous avons identifié tous les individus ayant eu une primo-infection pendant les périodes de dominance de chaque variante pour calculer leur risque d’infection pendant la période de dominance BA.5 (Figure 1A). Nous avons regroupé BA.1 et BA.2 en raison de la transition lente entre les deux sous-variantes dans la population. Enfin, nous avons calculé le risque d’infection par BA.5 pour la population qui n’avait aucune infection documentée avant la dominance de BA.5 (1er juin 2022).

Nous avons constaté qu’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 avait un effet protecteur contre l’infection par BA.5 (Figure 1B et tableau S1 dans l’annexe supplémentaire, disponible avec le texte intégral de cette lettre sur NEJM.org), et cette protection était maximale pour une infection antérieure par BA.1 ou BA.2. Ces données doivent être considérées dans le contexte de percées d’infections dans une population fortement vaccinée, car au Portugal, plus de 98 % de la population étudiée aura terminé la série primaire avant 2022.

La conception de l’étude ne peut pas éliminer tous les facteurs de confusion (voir la section Discussion dans l’annexe supplémentaire). De plus, une limitation est l’effet putatif de l’immunosuppression dans une population avec une immunité hybride (infection antérieure et vaccination). Nous avons constaté que l’infection par BA.1 ou BA.2 offrait une plus grande protection contre BA.5 chez les sujets vaccinés que l’infection par des variants pré-omicron, conformément à un rapport récent avec une conception de test négatif.5 Cependant, les infections BA.1 ou BA.2 se sont produites plus près de la période de dominance BA.5 que les infections avec des variantes antérieures. Compte tenu de l’incidence élevée d’infection par BA.5 chez les personnes ayant une infection antérieure par BA.1 ou BA.2, on pense que la protection conférée par une infection antérieure par BA.1 ou BA.2 est très faible. Nos données indiquent que cette perception est probablement une conséquence du plus grand nombre d’individus infectés par BA.1 ou BA.2 que ceux infectés par d’autres sous-variantes, et n’est pas étayée par les données.

Dans l’ensemble, nous avons constaté que les personnes ayant des antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2 étaient moins susceptibles d’avoir des percées d’infections par la sous-variante BA.5 dans une population fortement vaccinée, en particulier celles ayant déjà eu des infections BA.1 ou BA.2, que chez les personnes non infectées. personnes.

João Malato, M.Sc.
Institut de médecine moléculaire João Lobo Antunes, Lisbonne, Portugal

Ruy M. Ribeiro, D.Phil.
Laboratoire national de Los Alamos, Los Alamos, Nouveau-Mexique

Peter P. Leite, M.D.
Pedro Casaca, M.D.
Eugenia Fernandes, Ph.D.
Direction générale de la santé, Lisbonne, Portugal

Carlos Antunes, Ph.D.
Université de Lisbonne, Lisbonne, Portugal

Valter R. Fonseca, MD, Ph.D.
Direction générale de la santé, Lisbonne, Portugal

Manuel C. Gomes, Ph.D.
Université de Lisbonne, Lisbonne, Portugal

Luis Graca, MD, D.Phil.
Institut de médecine moléculaire João Lobo Antunes, Lisbonne, Portugal
[email protected]

Soutenu par l’Union européenne Horizon 2020 Programme de recherche et d’innovation (numéro de projet ERA, 952377-iSTARS) et par Fondation pour la science et la technologie au 081_596653860 et PTDC/MAT-APL/31602/2017 et au Institut national de la santé Accordez R01-AI116868.

Les formulaires de divulgation fournis par les auteurs avec le texte intégral de cette lettre sont disponibles sur NEJM.org.

Cette lettre a été publiée sur NEJM.org le 31 août 2022.

docteur Gomes et Graça ont également contribué à cette lettre.

  1. 1. Le P, Faraone J., Evans JP, et coll. Neutralisation des sous-variants SARS-CoV-2 omicron BA.4/5 et BA.2.12.1. N anglais J méd 2022;386 :25262528.

  2. 2. YuJ, collier est, Rowe M, et coll. Neutralisation des variants SARS-CoV-2 omicron BA.1 et BA.2. N anglais J méd 2022;386 :15791580.

  3. 3. Cao Y, C’est Simaï A, jian f, et coll. Anticorps BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 Escape induits par une infection par Omicron. La nature 2022;608 :593602.

  4. 4. Institut national de la santé Dr. Ricardo Jorge. Diversité génétique du nouveau coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19) au Portugal. (En portugais) 2022 (https://insaflu.insa.pt/covid19).

  5. 5. Altarawneh HN, chemaitelly h, Ayoub HH, et coll. Protection de l’infection naturelle par le SRAS-CoV-2 contre la réinfection par les sous-variants omicron BA.4 ou BA.5. Juillet 12, 2022 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.07.11.22277448v1). Formulaire.

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